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科目の基本情報
| 開講年度 | 2021 年度 | |
|---|---|---|
| 開講区分 | 生物資源学研究科(博士後期課程)資源循環学専攻 | |
| 受講対象学生 |
大学院(博士課程・博士後期課程) : 1年次, 2年次, 3年次 |
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| 選択・必修 | 選択 |
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| 授業科目名 | 菌類進化・分類学 | |
| きんるいしんか・ぶんるいがく | ||
| Systematic and evolutionary mycology | ||
| 単位数 | 2 単位 | |
| ナンバリングコード | BIOR-Reso-7491-007
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| 開放科目 | 非開放科目 | |
| 開講学期 |
後期集中 |
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| 開講時間 |
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| 授業形態 |
ハイブリッド授業 * 状況により変更される可能性があるので定期的に確認して下さい
「オンライン授業」・・・オンライン会議ツール等を利用して実施する同時双方向型の授業 |
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| 開講場所 | ||
| 担当教員 | 中島 千晴(生物資源学研究科資源循環学専攻), 白水貴(生物資源学研究科資源循環学専攻) | |
| NAKASHIMA Chiharu, SHIROUZU Takashi | ||
| 実務経験のある教員 | 中島千晴: 国際協力機構、独立行政法人製品評価技術基盤機構: 生物多様性の評価と生物多様性条約におけるABS対応の実務 | |
| SDGsの目標 |
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| 連絡事項 | * 状況により変更される可能性があるので定期的に確認して下さい |
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学修の目的と方法
| 授業の概要 | 異なる生物である植物寄生菌とその宿主植物の相互作用は細胞を介して互いに認識することから始まり、この相互作用が生物の進化に大きく影響を与えていると考えられる。そこで, これら異なる生物を材料として, 生物の分子系統進化を反映し, 且つ実用上有用な分類学は成立するか, また生物間相互作用が観察できるか, をテーマに, 研究手法および基礎的な知識について解説し, 議論を行う。 |
|---|---|
| 学修の目的 | 分子系統学、菌類分類学を高度かつ実践的な能力を議論と実際により身につける。 |
| 学修の到達目標 | 形態分類学, および分子系統解析の基礎理論を習得し, コンピュータを用いて系統樹を作成できるようにする。また, 得られた系統樹と現行の形態による植物寄生菌の分類を対比し, その対象生物の分類の妥当性と生物間の相互作用について評価できるようになる。 |
| ディプロマ・ポリシー |
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| 成績評価方法と基準 | 毎時間ごとのレポートの提出と議論への参加を義務とし、この条件を満たさない場合には減点(5-10点)し100点満点で60点以上が合格とする。 |
| 授業の方法 | 講義 |
| 授業の特徴 |
グループ学習の要素を加えた授業 Moodleを活用する授業 教員と学生、学生相互のやり取りが、ほぼ英語で進められる授業 |
| 授業改善の工夫 | 学生とのコミュニケーションを重要視する。 |
| 教科書 | 適宜配付する。 |
| 参考書 | |
| オフィスアワー | 毎週水曜日12:00～13:00，場所561号室 |
| 受講要件 | とくになし。 |
| 予め履修が望ましい科目 | とくになし。 |
| 発展科目 | とくになし。 |
| その他 |
授業計画
| MoodleのコースURL |
|---|
| キーワード | 分子系統と分類, 菌類, 生物間相互作用, 系統 |
|---|---|
| Key Word(s) | Systematics, Fungi, Plant-Microbe Interactions, Phylogeny |
| 学修内容 | 第一回 菌類の分類学の基礎 第二回 分子系統解析の基礎 第三回 分子系統解析の基礎 第四回 近隣結合法による系統樹作成 第五回 最大節約法による系統樹作成 第六回 各種系統樹の評価法 第七回 各種系統樹の評価法 第八回 形態分類との比較 第九回 分類学利用現場に於ける系統分類の適用 第十回 分類学利用現場に於ける系統分類の応用 第十一回 分子系統樹と生態学 第十二回 分子系統樹と生態学 第十三回 分子系統樹の生態学への応用 第十四回 分子系統樹の生態学への応用 第十五回 分子系統樹の生態学への応用 第十六回 : 総合討論会 |
| 事前・事後学修の内容 | 事前学習用の論文セット、データセットは都度配布する 第一回 菌類の分類学の基礎 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第二回 分子系統解析の基礎 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第三回 分子系統解析の基礎 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第四回 近隣結合法による系統樹作成 : データセット作成の予習2時間、復習2時間 第五回 最大節約法による系統樹作成 : データセット作成の予習2時間、復習2時間 第六回 各種系統樹の評価法 : データセット作成の予習2時間、復習2時間 第七回 各種系統樹の評価法 : データセット作成の予習2時間、復習2時間 第八回 形態分類との比較 : データセット作成の予習2時間、復習2時間 第九回 分類学利用現場に於ける系統分類の適用 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十回 分類学利用現場に於ける系統分類の応用 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十一回 分子系統樹と生態学 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十二回 分子系統樹と生態学 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十三回 分子系統樹の生態学への応用 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十四回 分子系統樹の生態学への応用 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十五回 分子系統樹の生態学への応用 : 論文セットの予習2時間、復習2時間 第十六回 : 総合討論会 |
| 事前学修の時間:120分/回 事後学修の時間:120分/回 |