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科目の基本情報

開講年度 2024 年度
開講区分 生物資源学研究科(博士後期課程)生物圏生命科学専攻
受講対象学生 大学院(博士課程・博士後期課程) : 1年次
選択・必修 選択
授業科目名 物理生化学
ぶつりせいかがく
Physical Biochemistry
単位数 2 単位
ナンバリングコード
BIOR-Life-7491-002
開放科目 非開放科目    
開講学期

前期集中

開講時間
相談の上,授業時間を決める.
授業形態

対面授業

* 状況により変更される可能性があるので定期的に確認して下さい

「オンライン授業」・・・オンライン会議ツール等を利用して実施する同時双方向型の授業
「ハイブリッド授業」・・・「対面授業」と「オンライン授業」を併用した授業
「オンデマンド授業」・・・動画コンテンツの配信等によって実施する授業

開講場所 生物資源学部校舎577室

担当教員 三宅 英雄(生物資源学研究科生物圏生命科学専攻)

MIYAKE, Hideo

SDGsの目標
連絡事項

* 状況により変更される可能性があるので定期的に確認して下さい

学修の目的と方法

授業の概要 生体物質や現象の物理的取り扱いについて,下記の項目を講義する.また関連する学術論文を講読する.
酵素の触媒機構に関する解析手法と考察.
タンパク質の構造解析の手法と生化学への応用.
代謝熱を指標とした微生物熱測定と生化学への応用.
学修の目的 酵素を始めとしたタンパク質について,構造,安定性,反応機構などの視点から,定性的だけでなく定量的にも理解し、説明することができる力を身につけることを目的とする.微生物熱測定の原理や手法、その応用に関して理解し、説明できる.それらの知識を自らの研究にも応用することができる力を身につける.
学修の到達目標 酵素を始めとしたタンパク質について,構造,安定性,反応機構などの視点から,定性的だけでなく定量的にも理解し、説明することができる.微生物熱測定の原理や手法、その応用に関して理解し、説明できる.それらの知識を自らの研究にも応用することができる.
ディプロマ・ポリシー
○ 学科・コース等の教育目標

○ 全学の教育目標
感じる力
  •  感性
  •  共感
  •  主体性
考える力
  •  幅広い教養
  • ○専門知識・技術
  • ○論理的・批判的思考力
コミュニケーション力
  •  表現力(発表・討論・対話)
  •  リーダーシップ・フォロワーシップ
  •  実践外国語力
生きる力
  •  問題発見解決力
  •  心身・健康に対する意識
  •  社会人としての態度・倫理観

成績評価方法と基準 レポート100%
授業の方法 講義

授業の特徴

PBL

特色ある教育

英語を用いた教育

教員と学生のやり取りは日本語でも、英語による論文や教材の講読を含んだ授業
授業アンケート結果を受けての改善点
教科書 使用しない.
必要に応じて資料を配布する
参考書 物理生化学(医学出版),タンパク質の構造と機構(医学出版)
オフィスアワー miyake@bio.mie-u.ac.jp
受講要件 タンパク質化学, 物理化学, 生物物理化学(学士課程開講科目),分子生物情報学特論(大学院前期課程開講科目)
予め履修が望ましい科目 特になし
発展科目
その他

授業計画

各回
共通
MoodleのコースURL
第1回 概要 タンパク質(一次構造, BLAST)
授業時間内の学修内容 講義:タンパク質(一次構造, BLAST)の解説
キーワード(Key Word(s)) タンパク質(protein), 一次構造(primary structure), Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題およびBLASTを使った相同性検索の練習
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第2回 概要 タンパク質(二次構造、CD測定)
授業時間内の学修内容 講義:タンパク質(二次構造、CD測定)の解説
キーワード(Key Word(s)) 二次構造(secondary structure), 円偏光二色性(circular dichroism)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第3回 概要 タンパク質(三次構造、X線結晶構造解析)
授業時間内の学修内容 講義:タンパク質(三次構造、X線結晶構造解析)の解説
キーワード(Key Word(s)) 三次元構造(tertiary structure), X線結晶構造解析(X-ray crystal structure analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄 配付資料の課題
第4回 概要 タンパク質(四次構造、ゲル濾過とSDS-PAGE)
授業時間内の学修内容 講義:タンパク質(四次構造、ゲル濾過とSDS-PAGE)
キーワード(Key Word(s)) 四次構造(quadratic structure), ゲル濾過(gel filtration), SDSポリアクリルアミド電気泳動(SDS-PAGE)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第5回 概要 タンパク質(タンパク質の変性)
授業時間内の学修内容 講義:タンパク質(タンパク質の変性)の解説
キーワード(Key Word(s)) 変性(denaturation)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第6回 概要 構造生物学(X線結晶構造解析の方法1)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(X線結晶構造解析の方法1)
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), X線結晶構造解析(X-ray crystal structure analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第7回 概要 構造生物学(X線結晶構造解析の方法2)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(X線結晶構造解析の方法2)の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), X線結晶構造解析(X-ray crystal structure analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第8回 概要 構造生物学(X線結晶構造解析の方法3
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(X線結晶構造解析の方法3の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), X線結晶構造解析(X-ray crystal structure analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第9回 概要 構造生物学(X線結晶構造解析の方法4)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(X線結晶構造解析の方法4)の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), X線結晶構造解析(X-ray crystal structure analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第10回 概要 構造生物学(ホモロジーモデリングの方法1)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(ホモロジーモデリングの方法1)の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), ホモロジーモデリング(homology modeling)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第11回 概要 構造生物学(ホモロジーモデリングの方法2)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(ホモロジーモデリングの方法2)の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), ホモロジーモデリング(homology modeling)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第12回 概要 構造生物学(NMR, 中性子構造解析)
授業時間内の学修内容 講義:構造生物学(NMR, 中性子構造解析)の解説
キーワード(Key Word(s)) 構造生物学(structural biology), NMR, 中性子構造解析(neutron structural analysis)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第13回 概要 熱測定(示差走査熱量計)
授業時間内の学修内容 講義:熱測定(示差走査熱量計)の解説
キーワード(Key Word(s)) 熱測定(calorimetry), 示差走査熱量計(Differential scanning calorimetry)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第14回 概要 熱測定(等温滴定型熱量計)
授業時間内の学修内容 講義:熱測定(等温滴定型熱量計)の解説
キーワード(Key Word(s)) 熱測定(calorimetry), 等温滴定型熱量計(isothermal titration calorimetry)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄
第15回 概要 熱測定(微生物熱測定)
授業時間内の学修内容 講義:熱測定(微生物熱測定)の解説
キーワード(Key Word(s)) 熱測定(calorimetry), 微生物熱測定(microbial calorimetry)
事前学修の内容 配付資料の予習
事前学修の時間 120分
事後学修の内容 配付資料の課題
事後学修の時間 120分
自由記述欄

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